Englisches Original: https://argusic.com/subject/biomcp
biomcp
BioMCP: Biomedizinisches Modell-Kontext-Protokoll
LäuftQuelle: GitHubHomepageRustMITCommit 9e960ee32102
Rust, Lizenz MIT. Das Projekt beschreibt sich selbst als: ai, bioinformatics, clinical trials, genomics, llm, mcp, mcp server und medical.
biomcp läuft. Ein Argusic-Agent hat es in 54 Minuten installiert und ist auf 7 Fehler gestoßen. Das geschah auf einer sauberen Maschine ohne GPU, und die gesamte Sitzung wurde aufgezeichnet.
BioMCP 0.9.1 builds, installs to PATH, runs CLI queries against 51 live biomedical APIs, serves MCP over HTTP (health endpoint returns 200), and passes 3909 Rust tests plus 1195 Python contract tests.
Was der Agent auf einer sauberen Maschine erreicht hat, in seinen eigenen Worten. So wird gemessen
Von Argusic jedes Mal auf einer frischen Maschine gemessen. Jede Zahl verlinkt auf ihren Nachweis. Argusic Score 94,3 von 100 (der Mittelwert der Lauf-Scores dieses Projekts).
Auf einen Blick
Projektdaten von GitHub, oben auf dieser Seite verlinkt, aktualisiert . Testdaten von Argusic (CC BY 4.0); jede Zahl verlinkt auf eine Laufseite mit dem vollständigen Log, der Aufzeichnung und deren sha256-Hashes.
Was gemessen wurde
Aus dem Lauf, der diesen Befund entschieden hat. Jede Zeile ist ein aufgezeichneter Wert, keine Schätzung.

Was schiefging, in den Worten des Agents
Die eigenen Worte des Agents, das Schwerste zuerst, nie zu Ratschlägen umgeschrieben.
- Rust toolchain (rustc, cargo) not pre-installed15 Minuten
- cargo-nextest not pre-installed (required for test runner)6 Minuten
- cargo-deny not pre-installed (required for lint)5 Minuten
- uv package manager not pre-installed1 Minute
- mustmatch standalone binary not installed (required for spec contracts)1 Minute
- bwrap user-namespace sandboxing unavailable (kernel restriction in container)
- Installationszeit
- 54 Minuten
- Von der kalten Maschine bis zum Ende
- 55 Minuten
- Aufgetretene und behobene Fehler
- 7 aufgetreten, 5 ohne menschliche Hilfe behoben
- Wie das Ergebnis belegt wurde
- cargo nextest run --locked --no-default-features exited 0 (3909 passed, 33 skipped); pytest tests/ with 12 environment-specific exclusions passed 1195/1195 (0 failures); biomcp --version returned 'biomcp 0.9.1+g9e960ee3'; biomcp health --apis-only reported 51/52 APIs reachable; biomcp serve-http answered 200 on /health and /readyz returned {'status':'ok'}
- Verbrauchte Modell-Tokens
- 127.047
- Genau getesteter Commit
- 9e960ee32102
- Container-Image
- sha256:cdd920bce783
Was nicht gemessen wurde
Die andere Hälfte, damit Sie genau sehen, wie weit dieser Nachweis reicht. Eine Lücke wird als Lücke angezeigt und nie aufgefüllt.
- Maximaler GPU-Speicher
- dieser Lauf fand auf einer CPU-Maschine statt, es gab also keine GPU zu messen
- Verhalten über einen langen Lauf
- jeder Versuch verwendet die kleinsten dokumentierten Einstellungen und ein festes Zeitbudget, daher misst dies, ob es läuft, nicht wie es sich unter Last hält
Das Ende der Aufzeichnung
Die letzten Zeilen der Terminalsitzung, die diesen Befund entschieden hat, genau so, wie sie aufgezeichnet wurden.
51 Now I have all the data. Let me compile the final result. exec /bin/sh -lc 'echo "Started around $(date -d '"'2026-10-16 01:43' +%s)\"; echo \"Ended around "'$(da… succeeded in 0ms: Started around 1792114980 Ended around 1792118234 Diff minutes: 54 All data collected. Here is the final result: tokens used 127,047 All data collected. Here is the final result:
Gesamte Sitzung abspielen, jeder Befehl von einer sauberen Maschine bis zu diesem Punkt.
So wurde getestet
Ein Agent, ein Container, keine menschliche Hilfe. Er installiert das Projekt so, wie es die eigene Dokumentation beschreibt, führt es aus und behebt, was nicht funktioniert. Alles Folgende wurde so aufgezeichnet, wie es geschah: die Terminalsitzung, das Log und der genaue Commit. Die vollständige Methodik.
Stärken und Grenzen
Gemessene Fakten, keine Meinungen. Wie diese Inhalte entstehen.
Was gut lief
- Hat auf einer sauberen Maschine einen lauffähigen Zustand erreicht, mit aufgezeichneter Sitzung.
- Lief ohne GPU, braucht also keine, um zu starten.
- Lizenz MIT, laut Angabe des Hosts.
Was nicht lief oder unbekannt ist
- Die Installation dauerte 54 Minuten, langsamer als der Median der 230 vergleichbaren Projekte, die Argusic gemessen hat.
- Ist bei der Einrichtung auf 7 Fehler gestoßen, davon 2 nicht gelöst.
- Bisher einmal gemessen. Ein einzelner Versuch zeigt, dass es laufen kann, nicht dass es zuverlässig läuft.
Von den 231 Projekten im Bereich ai, die Argusic installiert und zeitlich gemessen hat, belegte biomcp Platz 228 bei der Zeit bis zum lauffähigen Zustand, und 152 von 231 erreichten überhaupt einen solchen Zustand.
Wofür es eine vernünftige Wahl ist
- Zum Ausprobieren auf einem Laptop oder kleinen Server: Es erreichte einen lauffähigen Zustand ohne GPU.
Ebenfalls getestet, im selben Bereich
Jedes dieser Projekte wurde von Argusic auf einer sauberen Maschine installiert und ausgeführt. Hier erscheint nichts, was nicht getestet wurde.
Laufverlauf
Themen (von GitHub)
aibioinformaticsclinical-trialsgenomicsllmmcpmcp-servermedicalmodel-context-protocolpubmedpubmed-central
Badge einbetten
Markdown für die README des Projekts. Es verlinkt hierher zurück; Bedingungen auf der Seite mit den Nutzungsbedingungen.
[](https://argusic.com/subject/biomcp)Fragen
- Läuft biomcp?
- Ja. biomcp läuft. Argusic hat es auf einer sauberen Maschine in 54 Minuten installiert und gestartet, ist dabei auf 7 Fehler gestoßen und hat die Sitzung aufgezeichnet.
- Wie hat Argusic biomcp getestet?
- Auf einer frischen Einwegmaschine, mit jedem Befehl aufgezeichnet und dem Repository fixiert auf Commit 9e960ee32102. Ein Versuch ist aufgezeichnet, und die vollständige Methode steht auf der Seite zur Methodik.
- Was hat der Test von biomcp gekostet?
- Der Lauf, der diesen Befund ergab, kostete 0,15 USD: echte Rechen- und Modellkosten, kein Listenpreis pro Million Tokens. Der Betrag ist auf der Seite dieses Laufs aufgezeichnet.
- Wie lange dauert die Installation von biomcp?
- 54 Minuten in dem Lauf, der diesen Befund entschieden hat, von einer sauberen Maschine bis zum lauffähigen Zustand. Das ist ein gemessener Versuch, kein Durchschnitt.
- Braucht biomcp eine GPU?
- Nicht zum Starten. Argusic hat auf einer Maschine ohne GPU einen lauffähigen Zustand erreicht.
- Was geht bei der Installation von biomcp schief?
- Im aufgezeichneten Lauf gingen 7 Dinge kaputt, und 5 davon wurden ohne menschliche Hilfe behoben. Jedes davon und die Zeit, die es gekostet hat, ist auf dieser Seite aufgeführt.
- Wie schneidet biomcp im Vergleich zu Alternativen ab?
- Von den 231 Projekten im Bereich ai, die Argusic installiert und zeitlich gemessen hat, belegte biomcp Platz 228 bei der Zeit bis zum lauffähigen Zustand, und 152 von 231 erreichten überhaupt einen solchen Zustand.
- Wo ist der Nachweis für biomcp?
- Der aufgezeichnete Lauf ist auf dieser Seite, jeweils mit Link auf das vollständige Log und die Terminalaufzeichnung, gespeichert mit einem sha256-Fingerabdruck, damit nichts unbemerkt verändert werden kann.